Considerada como Patrimonio Cultural de la Salud del Paraguay, el Hospital de Clínicas llamado inicialmente Hospital de Caridad, remonta sin embargo sus orígenes ya desde el año 1877, cuando la Junta Económica Administrativa de la ciudad (equivalente en la actualidad a la Municipalidad), constituyó una comisión directiva que tenía a su cargo la organización y sostenimiento de un hospital de caridad.
El local elegido fue el llamado “Hospital Potrero”, que quedó instalado en el mismo centro donde había funcionado durante la Guerra de la Triple Alianza un hospital de sangre y correspondía al solar donde hoy se encuentra el actual Hospital Militar.